《秘密入侵》原本的導演之一在拍攝前離開了該項目，一位《秘密入侵》的製片人解釋了原因。
《秘密入侵》於2021年5月找到了導演阿里·薩利姆和托馬斯·伯祖查，托馬斯·伯祖查於9月在項目開始製作之前離開了。
在The Playlist Podcast Network的節目中，秘密入侵導演阿里·薩利姆透露了為什麼原本應該和他一起執導這個項目的托馬斯·伯祖查在拍攝之前離開了。
當被問到在大多數MCU系列影集中多數有多位導演各自負責幾集時，他是如何執導全部六集時，阿里·薩利姆解釋了最初的計劃是讓托馬斯·伯祖查執導前三集，而他負責後三集：
阿里·薩利姆表示 :「嗯，當我加入時，我們有兩位導演，我打算執導4、5、6集，而我的朋友托馬斯·伯祖查打算執導1、2、3集。」
阿里·薩利姆補充說 :「然後，他和我一起籌備了一段時間，但後來我們可能因為他的時間限制或其他原因進入了預定限制，因為我想影集延遲了幾次，他必須離開…他參與了《冰血暴》的這一季。所以，他不得不為那個工作離開。」
值得注意的是，秘密入侵在2021年9月開始拍攝，早於《冰血暴》第五季的續訂在2022年初宣布，這更加引發了人們對托馬斯·伯祖查所謂的時間安排衝突的疑問。
阿里·薩利姆繼續說道 :「對我來說很棒，我想也許他的離開時間有點不合時宜…他的離開對漫威來說有點不合時宜，所以我成為了匆忙填補那些集數的一部分。但我認為最終，正如我所說的，對我來說效果很好，我認為對演員來說也很好。漫威沒有投訴，所以我想他們很高興讓一位導演來講述整個故事。」
在接受Collider採訪時，尼克·福瑞的扮演者山繆·傑克森透露，托馬斯·伯祖查在與他見面的隔天退出了該項目：
山繆·傑克森表示 :「有趣的是，當我剛開始參與《秘密入侵》時，阿里·薩利姆是兩位導演之一，我與他（阿里·薩利姆）見面，然後我見了另一位導演，第二天另一位導演（托馬斯·伯祖查）就退出了。」
大多數漫威MCU宇宙的影集基本上是將長片分成六集。因此，只有一位導演負責所有集數有助於在整個系列中創造出一致的感覺、風格和調性，就像實際的電影一樣。
在之前提到的Collider採訪中，山繆·傑克森稱讚了阿里·薩利姆負責每一集的做法，這使他能夠以更“一致”的方式來塑造《秘密入侵》：
山繆·傑克森說道 :「但我認為阿里·薩利姆堅持下來是很棒的，我認為更重要的是他們允許他執導所有集數，這給我們帶來了他對節目想要的理念或概念的一致性，所以他能夠以特定的方式來塑造它，或者說服我們我們正在以我們的方式來塑造它，但最終卻變成了他的方式。」
在漫威影業的八部影集中，有四部是由一位導演負責的，包括《汪達幻視》、《獵鷹與酷寒戰士》、《洛基》和《秘密入侵》，而其他部分則由多位導演創作的包括《月光騎士》、《驚奇少女》、《律師女浩克》和《鷹眼》。
只有時間能告訴我們，阿里·薩利姆或托馬斯·伯祖查是否會與漫威影業再度合作，參與未來的電影或影集。然而，針對該系列的批評和負面反應可能會讓前者再次參與其他項目的機會受到損害。
《秘密入侵》現已在Disney+上線。